會計電算化制度是一種實際計算機技術(shù)實現(xiàn)程序會計核算和財務管理的，它的出現(xiàn)極高地增加了會計工作的效率和準確性。然而，與此同時，會計電算化制度也存在地著一些缺點，這些個缺點不單會影響大到會計工作的質(zhì)量，還肯定對企業(yè)的經(jīng)營產(chǎn)生不利影響。

缺乏靈活性

會計電算化制度的一個缺點是嚴重缺乏靈活性。一旦制定并執(zhí)行了會計電算化制度，就很難進行修改。這是只不過會計電算化制度的修改要新的編寫程序，這樣會增加企業(yè)的成本和時間。不過，要是企業(yè)必須對會計電算化制度接受如何修改，可能會需要請專業(yè)人員接受直接修改，這也會減少企業(yè)的成本。

技術(shù)要求高

會計電算化制度是需要不使用計算機技術(shù)，所以，不使用會計電算化制度是需要應具備一定的計算機技術(shù)知識。是對一些不具備什么計算機技術(shù)知識的人員來說，在用會計電算化制度可能會存在一定的困難。這就需要企業(yè)對員工進行培訓，這也會減少企業(yè)的成本。

安全性不高

會計電算化制度是需要可以使用計算機技術(shù)，因此，會計電算化制度的安全性確實是一個問題。如果企業(yè)的計算機系統(tǒng)被黑客攻擊，會計電算化制度的數(shù)據(jù)肯定會被竊奪或被破壞。這對企業(yè)的財務安全會導致嚴重的影響。

需要大量的數(shù)據(jù)輸入

會計電算化制度需要大量的數(shù)據(jù)輸入，這對企業(yè)的員工而言是一項繁瑣的工作。如果沒有數(shù)據(jù)輸入錯誤，會計電算化制度的數(shù)據(jù)也會出現(xiàn)錯誤。這就必須企業(yè)對員工參與培訓，以必須保證數(shù)據(jù)的準確性。

容易出現(xiàn)漏洞

會計電算化制度必須使用計算機技術(shù)，并且，會計電算化制度太容易再次出現(xiàn)漏洞。如果沒有漏洞被黑客攻擊，會計電算化制度的數(shù)據(jù)肯定會被侵吞或毀壞。這對企業(yè)的財務安全會導致嚴重的影響。

難以保證數(shù)據(jù)的準確性

會計電算化制度是需要大量的數(shù)據(jù)輸入，如果沒有數(shù)據(jù)輸入錯誤，會計電算化制度的數(shù)據(jù)也會又出現(xiàn)錯誤。并且，如果會計電算化制度的程序出現(xiàn)錯誤，也會導致數(shù)據(jù)的錯誤。這就不需要企業(yè)對員工接受培訓吧，以確保數(shù)據(jù)的準確性，但是要對會計電算化制度的程序并且嚴格的的測試和檢查。

需要大量的資金投入

會計電算化制度要建議使用計算機技術(shù)，因此，需要大量的資金投入。企業(yè)需要購買計算機設(shè)備、軟件、網(wǎng)絡設(shè)備等，這些都必須大量的資金投入。而且，假如企業(yè)是需要對會計電算化制度并且修改，也要耗去大量的資金。

不適用于所有企業(yè)

會計電算化制度不區(qū)分于全部企業(yè)。是對一些小型企業(yè)對于，會計電算化制度可能會會增加企業(yè)的成本，而且肯定會對企業(yè)的員工導致一定的困難。所以，企業(yè)需要依據(jù)自身的情況來判斷如何確定可以使用會計電算化制度。

容易出現(xiàn)人為錯誤

會計電算化制度不需要大量的數(shù)據(jù)輸入，如果沒有數(shù)據(jù)輸入錯誤，會計電算化制度的數(shù)據(jù)也會直接出現(xiàn)錯誤。而且，要是會計電算化制度的程序又出現(xiàn)錯誤，也會可能導致數(shù)據(jù)的錯誤。這就是需要企業(yè)對員工并且培訓班，以必須保證數(shù)據(jù)的準確性，因此要對會計電算化制度的程序進行嚴格的測試和檢查。

會計電算化制度的出現(xiàn)頗大地增強了會計工作的效率和準確性，只不過，會計電算化制度也必然著一些缺點。企業(yè)要依據(jù)自身的情況來改變是否是不使用會計電算化制度，并且需要對會計電算化制度接受嚴格的管理和壓制，以確保全數(shù)據(jù)的準確性和安全性。